На первом этапе разработки проекта НДС производится расчет годового количества вод, поступающих в водный объект, анализ фоновых концентраций загрязненности водоема, на основании чего производится расчет фактического и нормативно-допустимого сброса загрязняющих веществ.
Второй этап включает в себя сопровождение проекта при согласовании (по возможности параллельно):
-       в территориальных органах Росгидромета;